Gdańsk: ZP/8/2012 Usługa głębokiego sekwencjonowania DNA dla egzomu


Numer ogłoszenia: 29357 - 2012; data zamieszczenia: 03.02.2012

OGŁOSZENIE O ZAMÓWIENIU - usługi


Zamieszczanie ogłoszenia:
obowiązkowe.


Ogłoszenie dotyczy:
zamówienia publicznego.

SEKCJA I: ZAMAWIAJĄCY


I. 1) NAZWA I ADRES:
Gdański Uniwersytet Medyczny , ul. M. Skłodowskiej-Curie 3a, 80-210 Gdańsk, woj. pomorskie, tel. (058) 349 12 23, faks (058) 349 12 24.


  • Adres strony internetowej zamawiającego:
    www.gumed.edu.pl


I. 2) RODZAJ ZAMAWIAJĄCEGO:
Uczelnia publiczna.

SEKCJA II: PRZEDMIOT ZAMÓWIENIA


II.1) OKREŚLENIE PRZEDMIOTU ZAMÓWIENIA


II.1.1) Nazwa nadana zamówieniu przez zamawiającego:
ZP/8/2012 Usługa głębokiego sekwencjonowania DNA dla egzomu.


II.1.2) Rodzaj zamówienia:
usługi.


II.1.3) Określenie przedmiotu oraz wielkości lub zakresu zamówienia:
1. Przedmiotem zamówienia jest usługa głębokiego sekwencjonowania DNA dla egzomu w ramach realizowanego projektu: Opracowanie molekularnych testów wspomagających wykrywanie wczesnego raka płuca - MOLTEST 2013. Projekt współfinansowany z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego w ramach Programu Operacyjnego Innowacyjna Gospodarka, 2007-2013; 2. Wykonawca zapewni: A) wykonanie usługi metodą głębokiego sekwencjonowania (ang. next generation sequencing) DNA dla egzomu - dostarczonego przez zamawiającego materiału: 144 próbek DNA wyizolowanych z ludzkich kożuszków leukocytarnych standardowym zestawem firmy Qiagen (QIAamp DNA Blood Mini kit, nr kat 51104), w tym: egzonów genów kodujących białka, regionów nie ulegających translacji (sekwencje 3 i 5 UTR), niekodujących krótkich RNA, (w tym sekwencji kodujących, wymienionych w załączniku nr 4 do SIWZ - lista mikroRNA. B) Wśród analizowanych próbek będą 2 powtórzone próbki (tj. po 2 próbki od 2 pacjentów). C) Wykonawca przekaże Zamawiającemu uzyskane surowe dane na nośniku elektronicznym bez analizy statystycznej uzyskanych wyników. D) Dopuszczalny odsetek próbek, dla których niemożliwy jest odczyt surowych danych z głębokiego sekwencjonowania wynosi 3%. E) Wykonawca zapewnia, że wymagana usługa zostanie wykonana przy użyciu urządzeń spełniających wymagania systemu zgodności (certyfikowanych) z odpowiednimi normami dyrektyw UE. 3. Szczegółowo usługa obejmuje: Kontrolę jakości. Przesłanie drogą elektroniczną raportu dotyczącego przeprowadzonej kontroli jakości przesłanego materiału. Przygotowanie biblioteki DNA (ang. DNA library). Wzbogacanie egzomu (ang. exome enrichment). Wytwarzanie klastrów (ang. cluster generation). 4. Wymagania szczególne dla platformy do głębokiego sekwencjonowania: średnia głębokość sekwencjonowania (ang. coverage) - minimum 50 x, przestrzeń tarczowa (ang. target space) minimum 60 Mb (Mb=megazasad), minimum 20.000 genów, minimum 200.000 egzonów, 5. Próbki zostaną przesłane przez Zamawiającego na adres Wykonawcy wskazany w formularzu oferty. 6. Próbki zostaną przesłane do Wykonawcy na koszt Zamawiającego przesyłką kurierską w coolerach (schłodzone + 4-8°C). 7. Reklamacje będą zgłaszane drogą elektroniczną przez Zamawiającego. Wykonawca potwierdza mailowo przyjęcie reklamacji. W przypadku błędów Wykonawcy, zlecenie zostanie bezpłatnie wykonane ponownie w jak najkrótszym czasie, nie dłuższym jednak niż 30 dni robocze..


II.1.4) Czy przewiduje się udzielenie zamówień uzupełniających:
tak.


  • Określenie przedmiotu oraz wielkości lub zakresu zamówień uzupełniających
  • Zamawiający przewiduje udzielenie zamówień uzupełniających - do 50% zamówienia podstawowego


II.1.5) Wspólny Słownik Zamówień (CPV):
73.31.10.00-6.


II.1.6) Czy dopuszcza się złożenie oferty częściowej:
nie.


II.1.7) Czy dopuszcza się złożenie oferty wariantowej:
nie.



II.2) CZAS TRWANIA ZAMÓWIENIA LUB TERMIN WYKONANIA:
Okres w dniach: 60.

SEKCJA III: INFORMACJE O CHARAKTERZE PRAWNYM, EKONOMICZNYM, FINANSOWYM I TECHNICZNYM


III.2) ZALICZKI


  • Czy przewiduje się udzielenie zaliczek na poczet wykonania zamówienia:
    nie


III.3) WARUNKI UDZIAŁU W POSTĘPOWANIU ORAZ OPIS SPOSOBU DOKONYWANIA OCENY SPEŁNIANIA TYCH WARUNKÓW


  • III.3.2) Wiedza i doświadczenie


    Opis sposobu dokonywania oceny spełniania tego warunku

    • 1. O udzielenie zamówienia mogą ubiegać się Wykonawcy, którzy spełniają warunki dotyczące: 2) posiadania wiedzy i doświadczenia tj.; Zamawiający uzna warunek za spełniony, jeżeli Wykonawca wykaże się wykonaniem w okresie ostatnich 3 lat przed upływem terminu składania ofert, a jeżeli okres prowadzenia działalności jest krótszy - w tym okresie: co najmniej 3 (trzy) analizy głębokiego sekwencjonowania z czego każda analiza na kwotę nie mniejszą niż 400.000zł netto, w tym co najmniej jedno sekwencjonowanie egzomu.


III.4) INFORMACJA O OŚWIADCZENIACH LUB DOKUMENTACH, JAKIE MAJĄ DOSTARCZYĆ WYKONAWCY W CELU POTWIERDZENIA SPEŁNIANIA WARUNKÓW UDZIAŁU W POSTĘPOWANIU ORAZ NIEPODLEGANIA WYKLUCZENIU NA PODSTAWIE ART. 24 UST. 1 USTAWY


  • III.4.1) W zakresie wykazania spełniania przez wykonawcę warunków, o których mowa w art. 22 ust. 1 ustawy, oprócz oświadczenia o spełnieniu warunków udziału w postępowaniu, należy przedłożyć:

    • wykaz wykonanych, a w przypadku świadczeń okresowych lub ciągłych również wykonywanych, dostaw lub usług w zakresie niezbędnym do wykazania spełniania warunku wiedzy i doświadczenia w okresie ostatnich trzech lat przed upływem terminu składania ofert albo wniosków o dopuszczenie do udziału w postępowaniu, a jeżeli okres prowadzenia działalności jest krótszy - w tym okresie, z podaniem ich wartości, przedmiotu, dat wykonania i odbiorców, oraz załączeniem dokumentu potwierdzającego, że te dostawy lub usługi zostały wykonane lub są wykonywane należycie

  • III.4.2) W zakresie potwierdzenia niepodlegania wykluczeniu na podstawie art. 24 ust. 1 ustawy, należy przedłożyć:

    • oświadczenie o braku podstaw do wykluczenia
    • aktualny odpis z właściwego rejestru, jeżeli odrębne przepisy wymagają wpisu do rejestru, w celu wykazania braku podstaw do wykluczenia w oparciu o art. 24 ust. 1 pkt 2 ustawy, wystawiony nie wcześniej niż 6 miesięcy przed upływem terminu składania wniosków o dopuszczenie do udziału w postępowaniu o udzielenie zamówienia albo składania ofert, a w stosunku do osób fizycznych oświadczenie w zakresie art. 24 ust. 1 pkt 2 ustawy
    • wykonawca powołujący się przy wykazywaniu spełniania warunków udziału w postępowaniu na potencjał innych podmiotów, które będą brały udział w realizacji części zamówienia, przedkłada także dokumenty dotyczące tego podmiotu w zakresie wymaganym dla wykonawcy, określonym w pkt III.4.2.
  • III.4.3) Dokumenty podmiotów zagranicznych

    Jeżeli wykonawca ma siedzibę lub miejsce zamieszkania poza terytorium Rzeczypospolitej Polskiej, przedkłada:

    III.4.3.1) dokument wystawiony w kraju, w którym ma siedzibę lub miejsce zamieszkania potwierdzający, że:

    • nie otwarto jego likwidacji ani nie ogłoszono upadłości - wystawiony nie wcześniej niż 6 miesięcy przed upływem terminu składania wniosków o dopuszczenie do udziału w postępowaniu o udzielenie zamówienia albo składania ofert


III.7) Czy ogranicza się możliwość ubiegania się o zamówienie publiczne tylko dla wykonawców, u których ponad 50 % pracowników stanowią osoby niepełnosprawne:
nie

SEKCJA IV: PROCEDURA


IV.1) TRYB UDZIELENIA ZAMÓWIENIA


IV.1.1) Tryb udzielenia zamówienia:
przetarg nieograniczony.


IV.2) KRYTERIA OCENY OFERT


IV.2.1) Kryteria oceny ofert:
najniższa cena.


IV.2.2) Czy przeprowadzona będzie aukcja elektroniczna:
nie.


IV.3) ZMIANA UMOWY


Czy przewiduje się istotne zmiany postanowień zawartej umowy w stosunku do treści oferty, na podstawie której dokonano wyboru wykonawcy:
tak


Dopuszczalne zmiany postanowień umowy oraz określenie warunków zmian

ZMIANY UMOWY 1. Zamawiający przewiduje możliwość zmian umowy w sytuacji: a) gdy dochowanie terminu umownego jest niemożliwe z uwagi na siłę wyższą lub inne okoliczności niezależne od Wykonawcy lub których Wykonawca przy zachowaniu należytej staranności nie był w stanie uniknąć lub przewidzieć. Przez siłę wyższą strony rozumieją okoliczności niemożliwe do przewidzenia w chwili zawierania umowy, niezależne od woli stron, na których powstanie żadna ze stron nie miała wpływu i których powstaniu nie mogła zapobiec. Za siłę wyższą uważa się w szczególności: klęski żywiołowe, katastrofy, mobilizację, embargo, zamknięcie granic. Wykonawca dotknięty działaniem siły wyższej jest zobowiązany do niezwłocznego powiadomienia o tym fakcie Zamawiającego, b) w przypadku zmiany adresu, nazwy Wykonawcy lub Zamawiającego, dopuszcza się zmiany w tym zakresie, c) w innych wypadkach, gdy zmiany nie są istotne. 2. Wszelkie zmiany niniejszej umowy wymagają formy pisemnej pod rygorem nieważności.


IV.4) INFORMACJE ADMINISTRACYJNE


IV.4.1)
 
Adres strony internetowej, na której jest dostępna specyfikacja istotnych warunków zamówienia:
www.gumed.edu.pl

Specyfikację istotnych warunków zamówienia można uzyskać pod adresem:
www.gumed.edu.pl oraz nieodpłatnie w Zespole Zamówień Publicznych Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego, budynek Rektoratu III piętro, pok. 313, ul. M. Skłodowskiej-Curie 3a, 80-210 Gdańsk.


IV.4.4) Termin składania wniosków o dopuszczenie do udziału w postępowaniu lub ofert:
13.02.2012 godzina 09:00, miejsce: Zespole Zamówień Publicznych Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego, budynek Rektoratu III piętro, pok. 313, ul. M. Skłodowskiej-Curie 3a, 80-210 Gdańsk.


IV.4.5) Termin związania ofertą:
okres w dniach: 30 (od ostatecznego terminu składania ofert).


IV.4.16) Informacje dodatkowe, w tym dotyczące finansowania projektu/programu ze środków Unii Europejskiej:
w ramach realizowanego projektu: Opracowanie molekularnych testów wspomagających wykrywanie wczesnego raka płuca - MOLTEST 2013. Projekt współfinansowany z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego w ramach Programu Operacyjnego Innowacyjna Gospodarka, 2007-2013.


IV.4.17) Czy przewiduje się unieważnienie postępowania o udzielenie zamówienia, w przypadku nieprzyznania środków pochodzących z budżetu Unii Europejskiej oraz niepodlegających zwrotowi środków z pomocy udzielonej przez państwa członkowskie Europejskiego Porozumienia o Wolnym Handlu (EFTA), które miały być przeznaczone na sfinansowanie całości lub części zamówienia:
nie


Numer ogłoszenia: 33405 - 2012; data zamieszczenia: 09.02.2012


OGŁOSZENIE O ZMIANIE OGŁOSZENIA


Ogłoszenie dotyczy:
Ogłoszenia o zamówieniu.


Informacje o zmienianym ogłoszeniu:
29357 - 2012 data 03.02.2012 r.

SEKCJA I: ZAMAWIAJĄCY

Gdański Uniwersytet Medyczny, ul. M. Skłodowskiej-Curie 3a, 80-210 Gdańsk, woj. pomorskie, tel. (058) 349 12 23, fax. (058) 349 12 24.

SEKCJA II: ZMIANY W OGŁOSZENIU


II.1) Tekst, który należy zmienić:


  • Miejsce, w którym znajduje się zmieniany tekst:
    IV.4.4).

  • W ogłoszeniu jest:
    IV.4.4) Termin składania wniosków o dopuszczenie do udziału w postępowaniu lub ofert: 13.02.2012 godzina 09:00, miejsce: Zespole Zamówień Publicznych Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego, budynek Rektoratu III piętro, pok. 313, ul. M. Skłodowskiej-Curie 3a, 80-210 Gdańsk..

  • W ogłoszeniu powinno być:
    IV.4.4) Termin składania wniosków o dopuszczenie do udziału w postępowaniu lub ofert: 22.02.2012 godzina 09:00, miejsce: Zespole Zamówień Publicznych Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego, budynek Rektoratu III piętro, pok. 313, ul. M. Skłodowskiej-Curie 3a, 80-210 Gdańsk..


Gdańsk: ZP/8/2012 Usługa głębokiego sekwencjonowania DNA dla egzomu


Numer ogłoszenia: 92629 - 2012; data zamieszczenia: 24.04.2012

OGŁOSZENIE O UDZIELENIU ZAMÓWIENIA - Usługi


Zamieszczanie ogłoszenia:
obowiązkowe.


Ogłoszenie dotyczy:
zamówienia publicznego.


Czy zamówienie było przedmiotem ogłoszenia w Biuletynie Zamówień Publicznych:
tak, numer ogłoszenia w BZP: 29357 - 2012r.


Czy w Biuletynie Zamówień Publicznych zostało zamieszczone ogłoszenie o zmianie ogłoszenia:
tak.

SEKCJA I: ZAMAWIAJĄCY


I. 1) NAZWA I ADRES:
Gdański Uniwersytet Medyczny, ul. M. Skłodowskiej-Curie 3a, 80-210 Gdańsk, woj. pomorskie, tel. (058) 349 12 23, faks (058) 349 12 24.


I. 2) RODZAJ ZAMAWIAJĄCEGO:
Uczelnia publiczna.

SEKCJA II: PRZEDMIOT ZAMÓWIENIA


II.1) Nazwa nadana zamówieniu przez zamawiającego:
ZP/8/2012 Usługa głębokiego sekwencjonowania DNA dla egzomu.


II.2) Rodzaj zamówienia:
Usługi.


II.3) Określenie przedmiotu zamówienia:
1. Przedmiotem zamówienia jest usługa głębokiego sekwencjonowania DNA dla egzomu w ramach realizowanego projektu: Opracowanie molekularnych testów wspomagających wykrywanie wczesnego raka płuca - MOLTEST 2013. Projekt współfinansowany z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego w ramach Programu Operacyjnego Innowacyjna Gospodarka, 2007-2013; 2. Wykonawca zapewni: A) wykonanie usługi metodą głębokiego sekwencjonowania (ang. next generation sequencing) DNA dla egzomu - dostarczonego przez zamawiającego materiału: 144 próbek DNA wyizolowanych z ludzkich kożuszków leukocytarnych standardowym zestawem firmy Qiagen (QIAamp DNA Blood Mini kit, nr kat 51104), w tym: egzonów genów kodujących białka, regionów nie ulegających translacji (sekwencje 3 i 5 UTR), niekodujących krótkich RNA, (w tym sekwencji kodujących, wymienionych w załączniku nr 4 do SIWZ - lista mikroRNA. B) Wśród analizowanych próbek będą 2 powtórzone próbki (tj. po 2 próbki od 2 pacjentów). C) Wykonawca przekaże Zamawiającemu uzyskane surowe dane na nośniku elektronicznym bez analizy statystycznej uzyskanych wyników. D) Dopuszczalny odsetek próbek, dla których niemożliwy jest odczyt surowych danych z głębokiego sekwencjonowania wynosi 3%. E) Wykonawca zapewnia, że wymagana usługa zostanie wykonana przy użyciu urządzeń spełniających wymagania systemu zgodności (certyfikowanych) z odpowiednimi normami dyrektyw UE. 3. Szczegółowo usługa obejmuje: Kontrolę jakości. Przesłanie drogą elektroniczną raportu dotyczącego przeprowadzonej kontroli jakości przesłanego materiału. Przygotowanie biblioteki DNA (ang. DNA library). Wzbogacanie egzomu (ang. exome enrichment). Wytwarzanie klastrów (ang. cluster generation). 4. Wymagania szczególne dla platformy do głębokiego sekwencjonowania: średnia głębokość sekwencjonowania (ang. coverage) - minimum 50 x, przestrzeń tarczowa (ang. target space) minimum 60 Mb (Mb=megazasad), minimum 20.000 genów, minimum 200.000 egzonów, 5. Próbki zostaną przesłane przez Zamawiającego na adres Wykonawcy wskazany w formularzu oferty. 6. Próbki zostaną przesłane do Wykonawcy na koszt Zamawiającego przesyłką kurierską w coolerach (schłodzone + 4-8°C). 7. Reklamacje będą zgłaszane drogą elektroniczną przez Zamawiającego. Wykonawca potwierdza mailowo przyjęcie reklamacji. W przypadku błędów Wykonawcy, zlecenie zostanie bezpłatnie wykonane ponownie w jak najkrótszym czasie, nie dłuższym jednak niż 30 dni robocze..


II.4) Wspólny Słownik Zamówień (CPV):
73.31.10.00-6.

SEKCJA III: PROCEDURA


III.1) TRYB UDZIELENIA ZAMÓWIENIA:
Przetarg nieograniczony


III.2) INFORMACJE ADMINISTRACYJNE


  • Zamówienie dotyczy projektu/programu finansowanego ze środków Unii Europejskiej:
    tak, projekt/program: w ramach realizowanego projektu: Opracowanie molekularnych testów wspomagających wykrywanie wczesnego raka płuca - MOLTEST 2013. Projekt współfinansowany z Europejskiego Funduszu Rozwoju Regionalnego w ramach Programu Operacyjnego Innowacyjna Gospodarka, 2007-2013..

SEKCJA IV: UDZIELENIE ZAMÓWIENIA


Część NR:
1   


Nazwa:
ZP/8/2012 Usługa głębokiego sekwencjonowania DNA dla egzomu


IV.1) DATA UDZIELENIA ZAMÓWIENIA:
27.03.2012.


IV.2) LICZBA OTRZYMANYCH OFERT:
3.


IV.3) LICZBA ODRZUCONYCH OFERT:
2.


IV.4) NAZWA I ADRES WYKONAWCY, KTÓREMU UDZIELONO ZAMÓWIENIA:

  • Source BioScience UK Limited, NG8 6PX, UK Company Reg No 4078501, {Dane ukryte}, Nottingham, kraj/woj. Zjednoczone Królestwo.


IV.5) Szacunkowa wartość zamówienia
(bez VAT): 532901,03 PLN.


IV.6) INFORMACJA O CENIE WYBRANEJ OFERTY ORAZ O OFERTACH Z NAJNIŻSZĄ I NAJWYŻSZĄ CENĄ


  • Cena wybranej oferty:
    589390,10


  • Oferta z najniższą ceną:
    589390,10
    / Oferta z najwyższą ceną:
    773837,28


  • Waluta:
    PLN.

Adres: ul. M. Skłodowskiej-Curie , 80-210 Gdańsk
woj. pomorskie
Dane kontaktowe: email: zp@gumed.edu.pl
tel: (058) 349 12 23
fax: (058) 349 12 24
Termin składania wniosków lub ofert:
2012-02-12
Dane postępowania
ID postępowania BZP/TED: 2935720120
ID postępowania Zamawiającego:
Data publikacji zamówienia: 2012-02-02
Rodzaj zamówienia: usługi
Tryb& postępowania [PN]: Przetarg nieograniczony
Czas na realizację: 60 dni
Wadium: -
Oferty uzupełniające: TAK
Oferty częściowe: NIE
Oferty wariantowe: NIE
Przewidywana licyctacja: NIE
Ilość części: 1
Kryterium ceny: 100%
WWW ogłoszenia: www.gumed.edu.pl
Informacja dostępna pod: www.gumed.edu.pl oraz nieodpłatnie w Zespole Zamówień Publicznych Gdańskiego Uniwersytetu Medycznego, budynek Rektoratu III piętro, pok. 313, ul. M. Skłodowskiej-Curie 3a, 80-210 Gdańsk
Okres związania ofertą: 30 dni
Kody CPV
Wyniki
Nazwa części Wykonawca Data udzielenia Wartość
ZP/8/2012 Usługa głębokiego sekwencjonowania DNA dla egzomu Source BioScience UK Limited, NG8 6PX, UK Company Reg No 4078501
Nottingham
2012-04-24 589 390,00