Dostawa odczynników chemicznych

Opis przedmiotu przetargu: Przedmiotem zamówienia jest dostawa do siedziby Zamawiającego odczynników chemicznych na potrzeby pracowni laboratoryjnych Leśnego Banku Genów Kostrzyca. 1 GeneScan™ 400HD ROX ™- Size Standard GeneScan™ 400HD ROX ™- Size Standard lub równoważny. Standard wielkości, który może być wykorzystany w analizatorze genetycznym Applied Biosystems 3130 Genetic Analyzer (rok produkcji 2007) oraz Applied Biosystems 3500 Genetic Analyzer; długość kapilary 36 cm i 50 cm • Pojemność opakowania wystarczająca do przeprowadzenia 800 rozdziałów • Standard wielkości zawiera 21 wyznakowanych fragmentów o następujących długościach [pz]: 50, 60, 90, 100, 120, 150, 160, 180, 190, 200, 220, 240, 260, 280, 290, 300, 320, 340, 360, 380, 400. • Fragmenty znakowane fluoroforem ROX, do detekcji filtrem wirtualnym D w analizatorze genetycznym 3130 Genetic Analyzer, skalibrowanym spektralnie matrycą Multi-Capillary DS-30 (Dye Set D) Matrix Std Kit • Opakowanie zawiera dwie 200 μl fiolki standardu • Opakowanie zawiera jedną 400 μl fiolkę buforu obciążającego, zawierającego blue dextran w stężeniu 500 mg/ml oraz 25 mM EDTA) • Odczynniki mogą być przechowywane w temperaturze 2°C – 4°C Op. 4 2 GeneScan™ 600 LIZ® Dye Size Standard GeneScan™ 600 LIZ® Dye Size Standard Nr kat. 4366589 lub równoważny. Standard wielkości dla analizowanych próbek DNA w analizatorze genetycznym Applied Biosystems 3130 Genetic Analyzer oraz Applied Biosystems 3500 Genetic Analyzer, długość kapilary 36 cm i 50 cm. • Pojemność opakowania wystarczająca do przeprowadzenia 800 reakcji. • Standard wielkości zawiera 36 wyznakowanych fragmentów o następujących długościach [pz]: 20, 40, 60, 80, 100, 114, 120, 140, 160, 180, 200, 214, 220, 240, 250, 260, 280, 300, 314, 320, 340, 360, 380, 400, 414, 420, 440, 460, 480, 500, 514, 520, 540, 560, 580, 600. Op. 4 3 BigDye Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit Zestaw BigDye Terminator v3.1 Cycle Sequencing Kit lub równoważny. Równoważność polega na zachowaniu następujących parametrów: zestaw zawierający wszystkie komponenty do przeprowadzenia 100 reakcji terminacji (metoda Sangera) przed sekwencjonowaniem DNA w analizatorze genetycznym 3130 Genetic Analyzer: • 1 × 800µl fiolka BigDye® Terminator v3.1 Ready Reaction Mix • 1 fiolka M13 (-21) Primer • 1 fiolka pGEM Control DNA • 2 × 1 ml fiolki of 5X Sequencing Buffer • Możliwość przechowywania zestawu w zamrożeniu (-30°C do -15°C); Odpowiedni do wysokoprzepustowego sekwencjonowania, do matryc bogatych w pary GC; do namnażania długich fragmentów DNA. Op. 5 4 BigDye XTerminator Purification Kit Zestaw BigDye XTerminator Purification Kit lub równoważny. Równoważność polega na zachowaniu następujących parametrów: zestaw zawierający wszystkie komponenty do przeprowadzenia 100 reakcji doczyszczania produktu PCR sekwencyjnego (metoda Sangera) przed sekwencjonowaniem DNA w analizatorze genetycznym 3130 Genetic Analyzer: • Umożliwia doczyszczanie produktu bez konieczności kilkukrotnego przenoszenia produktu; • Stabilizuje produkt przed rozpoczęciem analizy (do 48 h w temperaturze pokojowej); • Możliwość jednoczesnego użycia komponentów (premiks); • Całkowity czas oczyszczania – max. 40 min. • Zawiera: o XTerminator Solution – roztwór wyłapujący niezwiązane terminatory i sole; o SAM Solution – wspomaga działanie roztworu wyłapującego i stabilizuje produkt; • Kompatybilność z modułami programu DataCollection 4.0 firmy Life Technologies; Możliwość bezpośredniego przeprowadzenia elektroforezy z płytki z doczyszczonym produktem. Op. 9 5 3130 Matrix Standards Kit, BigDye Terminator v3.1 Zestaw 3130 Matrix Standards Kit, BigDye Terminator v3.1 lub równoważny. Równoważność polega na zachowaniu następujących parametrów: zestaw standardów kalibracyjnych zawierający wszystkie komponenty do przeprowadzenia kalibracji spektralnej analizatora genetycznego 3130 Genetic Analyzer przed zastosowaniem odczynników do sekwencjonowania Big Dye Terminator v.3.1 Cycle Sequencing Kit: • Możliwość przeprowadzenia co najmniej dwóch kalibracji; • Zawiera standard matrycy do sekwencjonowania złożony z co najmniej czterech fragmentów, z których każdy jest znakowany innym barwnikiem. Op. 1 6 3130 Genetic Analyzer Sequencing Standards, BigDye Terminator v3.1 Zestaw 3130 Genetic Analyzer Sequencing Standards, BigDye Terminator v3.1 lub równoważny. Równoważność polega na zachowaniu następujących parametrów: zestaw standardów kalibracyjnych zawierający wszystkie komponenty do przeprowadzenia kalibracji spektralnej analizatora genetycznego 3130 Genetic Analyzer przed zastosowaniem odczynników do sekwencjonowania Big Dye Terminator v.3.1 Cycle Sequencing Kit: • Możliwość przeprowadzenia co najmniej czterech kalibracji bądź czterech kontrolnych reakcji sekwencjonowania; • Zawiera standard sekwencyjny złożony z wielu fragmentów DNA znakowanych każdym z czterech barwników. Op. 1 7 5' Fluorescent Labeled/Unlabeled Pairs 14 par znakowanych fluorescencyjnie primerów o następujących parametrach: • sekwencja 5’ – 3’ i wyznakowanie zostaną załączone bezpośrednio do zamówienia • forma: liofilizat; • wymagane fluorofory (VIC, HEX, 6-FAM, NED, PET) możliwe do detekcji filtrem wirtualnym D w analizatorze genetycznym 3130 Genetic Analyzer, skalibrowanym spektralnie matrycą Multi-Capillary DS-30 (Dye Set D) Matrix Std Kit; • wyznakowanie primerów na 5`- końcu; • ilość 10 nmol/fiolkę x 28 fiolek; • każda fiolka opisana nazwą primera oraz jego sekwencją; • opakowane w fiolki z gwintem umożliwiające wielokrotne otwieranie/zamykanie; Para 14 8 310 Running Buffer 310 Running Buffer, 10X Nr kat. 402824 lub równoważny. Równoważność polega na dostarczeniu buforu umożliwiającego rozdział elektroforetyczny fragmentów DNA w kapilarnym analizatorze genetycznym Applied Biosystems 3130 Genetic Analyzer (Applied Biosystems®, obecnie Life Technologies, rok produkcji 2007), w kapilarach o długości 36 cm, przy zachowaniu zadanych parametrów napięcia i natężenia. Opakowanie nieprzezroczyste, zawiera 25ml 10x stężonego buforu. Op. 5 9 POP-7™ Polymer POP-7™ Polymer Nr kat. 4363929 lub równoważny. Polimer umożliwiający przeprowadzenie elektroforezy kapilarnej w kapilarach o długości 36 cm i 50 cm, podczas sekwencjonowania DNA oraz analizy fragmentów DNA w analizatorze genetycznym Applied Biosystems 3130 Genetic Analyzer (Applied Biosystems®, obecnie Life Technologies, rok produkcji 2007). Pojemność opakowania wynosi 28 ml. Op. 2 10 Hi-Di™ Formamide Hi-Di™ Formamide Nr kat. 4311320 lub równoważny. Wysoce dejonizowany formamid przeznaczony do przeprowadzania elektroforezy kapilarnej w analizatorze genetycznym Applied Biosystems 3130 Genetic Analyzer (Applied Biosystems®, obecnie Life Technologies, rok produkcji 2007), długość kapilary 36 cm i 50 cm. Pojemność opakowania 25 ml. Op. 3 11 Polimer POP-7 for 3500/3500xL Polimer POP-7 for 3500/3500xL lub równoważny. Równoważność polega na zachowaniu następujących parametrów: • Polimer umożliwiający przeprowadzenie elektroforezy kapilarnej w kapilarze o długości 50 cm. Podczas sekwencjonowania DNA oraz analizy fragmentów w analizatorze genetycznych 3500 Genetic Analyzer; • Pakowany w opakowanie rozpoznawalne przez system monitorowania pracy i daty ważności odczynników (RFID – ang. Radio Frequency Identification); • Opakowanie: 384 próby. Op. 7 12 Conditioning Reagent Odczynnik Conditioning Reagent lub równoważny. Równoważność polega na zachowaniu następujących parametrów: • Odczynnik rekomendowany przez producenta Analizatora Genetycznego 3500 Genetic Analyzer do stosowania przy prawidłowym przygotowaniu, przemywaniu pompy polimeru, przy zmianie typu polimeru, wyłączaniu analizatora genetycznego; • Zapakowany w opakowanie przygotowane do bezpośredniego zainstalowania na aparacie po uprzednim usunięciu folii zabezpieczającej; • Pakowany w opakowanie rozpoznawalne przez system monitorowania czasu pracy i daty ważności odczynników (RFID – ang. Radio Frequency Identification) Op. 4 13 Cathode Buffer Container (CBC) 3500 Bufor Cathode Buffer Container (CBC) 3500 lub równoważny. Równoważność polega na zachowaniu następujących parametrów: • Bufor katodowy rekomendowany przez producenta analizatora genetycznego 3500 Genetic Analyzer do prawidłowego przeprowadzenia procesu elektroforezy kapilarnej w analizatorze genetycznym 3500 Genetic Analyzer; • Bufor znajdujący się w kontenerze składającym się z dwóch oddzielnych pojemników – lewego przewidzianego na katodowy bufor do elektroforezy, prawego umożliwiającego przemycie kapilar i usuwanie zużytego polimeru pomiędzy iniekcjami; • Zapakowany w opakowanie przygotowane do bezpośredniego zainstalowania na aparacie po uprzednim usunięciu folii zabezpieczającej; • Pakowany w opakowanie rozpoznawalne przez system (RFID – ang. Radio Frequency Identyfication; • 4 sztuki w opakowaniu. Op. 11 14 Anode Buffer Container (ABC) 3500 Bufor Anode Buffer Container (ABC) 3500 lub równoważny. Równoważność polega na zachowaniu następujących parametrów: • Bufor anodowy rekomendowany przez producenta analizatora genetycznego 3500 Genetic Analyzer do prawidłowego przeprowadzenia procesu elektroforezy kapilarnej w analizatorze genetycznym 3500 Genetic Analyzer • Zapakowany w opakowanie przygotowane do bezpośredniego zainstalowania na aparacie po uprzednim usunięciu folii zabezpieczającej; • Pakowany w opakowanie rozpoznawalne przez system monitorowania czasu pracy i daty ważności odczynników (RFID – ang. Radio Frequency Identyfication); • 4 sztuki w opakowaniu Op. 11 15 Platinum Taq DNA Polymerase High Fidelity Zestaw Platinum Taq DNA Polymerase High Fidelity lub równoważny. Równoważność polega na zachowaniu następujących parametrów: zestaw zawierający następujące składniki w ilościach pozwalających na przeprowadzenie 100 reakcji PCR w objętościach 50 µl: • 20 µl 5U/µl polimerazy typu „hot start” o aktywności 5’→3’ egzonukleazy i 3’→5’ egzonukleolitycznej; • typ enzymu: mieszanina rekombinowanej przeciwciałem Taq polimerazy, polimerazy GB-D z Pyrococcus sp., przeciwciała Platinum Taq o wierności względem Taq co najmniej 6 do 1; • 1,25 ml 10x High Fidelity PCR Buffer; • 1 ml 50 mM MgSO4; • możliwość przechowywania zestawu w zamrożeniu (-30ºC do -10ºC); • aktywacja enzymu nie wymaga dodatkowych kroków w protokole. • Umożliwia efektywną amplifikację dłuższych fragmentów DNA (do 15 kb). Op. 1 16 Phusion High Fidelity DNA Polymerase Zestaw Platinum Taq DNA Polymerase High Fidelity lub równoważny. Równoważność polega na zachowaniu następujących parametrów: zestaw zawierający następujące składniki w ilościach pozwalających na przeprowadzenie 100 reakcji PCR w objętościach 50 µl: • 20 µl 2U/µl polimerazy typu „hot start” o aktywności 5’→3’ egzonukleazy i 3’→5’ egzonukleolitycznej; • typ enzymu: rekombinowana ligandem polimeraza z E.coli o wierności względem Taq co najmniej 52 do 1; • 2x 1,5 ml 5x Phusion High Fidelity PCR Buffer; • 1,5 ml 5x Phusion GC PCR Buffer; • 500 µl DMSO; • 1,5 ml 50 mM MgCl2; • aktywacja enzymu nie wymaga dodatkowych kroków w protokole; • umożliwia efektywną amplifikację dłuższych fragmentów DNA (do 20 kb) oraz matryc bogatych w pary GC. Op. 2