Zakup aparatury diagnostycznej dla wczesnego wykrywania nowotworów w zakresie zakupu wyposażenia laboratorium genetycznego (molekularnego/ cytogenetycznego) ... (1).

Opis przedmiotu przetargu: nazwa zakup aparatury diagnostycznej dla wczesnego wykrywania nowotworów w zakresie zakupu wyposażenia laboratorium genetycznego (molekularnego/ cytogenetycznego) dla personalizowanej opieki medycznej nad chorymi na nowotwory w 2017 r. (1). postępowanie zawiera 4 części, a szczegółowy opis w każdej części niniejszego ogłoszenia oraz w załącznikach nr 1a i 1b. ii.1.5)szacunkowa całkowita wartość ii.1.6)informacje o częściach to zamówienie podzielone jest na części tak oferty można składać w odniesieniu do wszystkich części ii.2)opis ii.2.1)nazwa sekwenator nowej generacji (ngs) i sprzęt peryferyjny część nr 1 ii.2.2)dodatkowy kod lub kody cpv 38000000 ii.2.3)miejsce świadczenia usług kod nuts pl213 główne miejsce lub lokalizacja realizacji zakład patologii nowotworów w siedzibie zamawiającego. ii.2.4)opis zamówienia 1.sekwenator (next generation sequencing) 1 szt. 1.aparat do sekwencjonowania dna (bez pomiaru fluorescencji, bez użycia optyki) w oparciu o półprzewodnikową technologię pomiaru zmiany ph po wbudowaniu nukleotydu na matrycy dna w każdym z ponad miliona naczyń reakcyjnych obecnych na chipie.2.możliwość od 3 mln odczytów (nośnik o najmniejszej przepustowości/ilości naczyń reakcyjnych) do 80 mln odczytów (nośnik o największej przepustowości/ilości naczyń reakcyjnych). podać przepustowość nośników3.zintegrowany serwer o parametrach nie gorszych niż procesor 6 core 3.5 ghz cpus, pamięć – 128 gb ram, przestrzeń dyskowa nie mniej niż – 16 tb 2.system do analizy bioinformatycznej po sekwencjonowaniu1 szt. serwer o parametrach nie gorszych niż processor dual 10 core e5 2.6 ghz cpus 128 gb ram 15 tb dostępnej przestrzeni dyskowej środowisko ubuntu™ 14.04 lts 3.fluorymetr do oceny jakości dna1 szt. fluorymetr służący do ultraczułych pomiarów ilościowych dna, rna, białek, mirna, cholesterolu, glukozy na zasadzie pomiaru fluorescencji 4.urządzenie do przygotowania bibliotek przed sekwencjonowaniem1 szt. moduł pozwalający na automatyczne przygotowanie matrycy oraz jej załadowanie na nośniki (chipy) pozwala w czasie jednego cyklu pracy na załadowanie 2 nośników (chipów) pozwala na przygotowanie matryc dla różnego rodzaju bibliotek jak rna, dna oraz z wykorzystaniem technologii ampliseq — pozwala na automatyczne przygotowanie bibliotek (2 pulowe) pozwala na pracę z różnej przepustowości nośnikami (chipami) ion 314™chip, ion 316™chip, ion 318™chip, ion pi™, ion 510™, ion 520™, ion 530™, ion 540™ 5.urządzenie do sprawdzania jakości bibliotek1 szt. 1. urządzenie służące do określania ilości i jakości dna i rna 2. analiza materiału na jednorazowych taśmach z oddzielonymi od siebie mikrokanałami (taśmy z mikrokanałami zawierają gotowy żel – brak konieczności przygotowywania żelu do elektroforezy)3. automatyczne określenie wielkości, ilości i jakości materiału. możliwość rozdziału całkowitego rna z czułością od 100pg/µl. fragmentów dna z czułością od 10pg/µl. genomowego dna z czułością od 0,5ng/µl4. oprogramowanie służące do sterowania urządzeniem umożliwia automatyczne określenie stopnia integralności rna – rine (ang. rna integritynumberequivalent) integralności genomowego dna – din (ang. dna integritynumber)5. automatyczne pobieranie próbek przy pomocy jednorazowych końcówek, co zabezpiecza przed zanieczyszczeniem krzyżowym6. analiza elektroforetyczna materiału poprzez pomiar fluorescencji wzbudzonej led7. minimalne zużycie badanego materiału (1 2 µl).8. kompatybilny laptop z preinstalowanym oprogramowaniem do akwizycji i analizy danych 6.magnes do separacji immunomagnetycznej1 szt.1.separator magnetyczny na probówki typu eppendorf 1,5 2 ml2. ilość probówek minimum 16 szt. 3. objętość separowanej mieszaniny 10 2000 µl 7.magnes do separacji immunomagnetycznej płytkowy1 szt. 1.separator magnetyczny do pracy z płytkami 96 dołkowymi lub pojedynczymi probówkami o pojemności 0,2 ml2.objętość separowanej mieszaniny 5 200 µl 8.spektrofotometr do pomiaru w kropli i w kuwecie 1szt.1. długość drogi optycznej w granicach 0,05 – 1 mm ustawiana automatycznie w zależności od stężenia próbki; objętość mierzonej próbki w zakresie 0,5µl – 2 µl; długość fali w granicach od 190 do 840 nm, pełny zakres skanowania. urządzenie musi efektywnie dokonywać pomiarów w w.w. zakresie; rozdzielczość widmowa <1,8 nm; precyzja pomiaru absorbancji 0,002 abs; dokładność pomiaru 2 %; dokładność zakresu długości fali ± 1 nm; zakres absorbancji w granicach od 0,02 do 300 abs2. statyw pomiarowy instrumentu nie może być elementem wymiennym aparatu. (pozostałe parametry w załączniku 1a do specyfikacji) 9.wirówka z możliwością wirowania płytek 96 dołkowych (izolacja dna/rna/białka)1 szt. 10.worteks (izolacja dna/rna/białka)2 szt. 1. 11.homogenizator1 szt. 1. (opis parametrów poz. 9,10,11 w załączniku 1a do siwz) — wszystkie pozycje zgodnie z opisem załącznika nr 1a. ii.2.5)kryteria udzielenia zamówienia kryteria określone poniżej kryterium jakości nazwa jakość / waga 30 cena waga 70 ii.2.6)szacunkowa wartość ii.2.7)okres obowiązywania zamówienia, umowy ramowej lub dynamicznego systemu zakupów okres w dniach 14 niniejsze zamówienie podlega wznowieniu nie ii.2.10)informacje o ofertach wariantowych dopuszcza się składanie ofert wariantowych nie ii.2.11)informacje o opcjach opcje nie ii.2.12)informacje na temat katalogów elektronicznych ii.2.13)informacje o funduszach unii europejskiej zamówienie dotyczy projektu/programu finansowanego ze środków unii europejskiej nie ii.2.14)informacje dodatkowe wadium 8 187 pln. wadium wnosi się w terminie i formie opisanej w specyfikacji. termin realizacji zamówienia dostawa, instalacja, uruchomienie, szkolenie nie później niż 14 dni od daty udzielenia zamówienia. ii.2)opis ii.2.1)nazwa sekwenator kapitalny część nr 2 ii.2.2)dodatkowy kod lub kody cpv 38000000 ii.2.3)miejsce świadczenia usług kod nuts pl213 główne miejsce lub lokalizacja realizacji zakład patologii nowotworów w siedzibie zamawiającego. ii.2.4)opis zamówienia 1. sekwenator kapilarny 1 szt. 1. analizator genetyczny do rozdziału fragmentów dna metodą kapilarną. 2. system umożliwiający sekwencjonowanie i analizę długości fragmentów dna metodą kapilarną. 3. wykonywanie na jednej płytce analizy sekwencji i długości fragmentów dna w jednym cyklu roboczym analizatora. 4. oprogramowanie do zarządzania funkcjami analizatora umożliwiające monitorowanie czasu pracy i daty ważności (rfid – radio frequency identification) odczynników i elementów zużywalnych, spełniających wymogi glp. 5. możliwość zastosowania odczynników i elementów zużywalnych w formacie ułatwiającym aplikację. 6. ilość kapilar w analizatorze minimum 8 (podać dokładną liczbę). 7. możliwość rozbudowy analizatora do 24 kapilar. 8. zapewnienie równoczesnej detekcji, co najmniej 6 różnych sygnałów fluorescencji w jednej kapilarze. 9. automatyczny podajnik próbek. " pojemność podajnika minimum 96 próbek. " możliwość ustalania kolejności pobierania próbek z płytki. 10. możliwość stosowania różnych zestawów do sekwencjonowania, w tym do matryc krótkich i długich, bogatych w pary gt i bogatych w pary at. podać numery katalogowe i nazwy własne zestawów. 11. system detekcji składający się z kamery ccd, lasera zbudowanego w oparciu o ciało stałe (505 nm) i filtrów wirtualnych. 12. komputer będący integralną częścią sekwenatora i oprogramowaniem minimalne parametry " procesor wielordzeniowy z częstotliwością taktowania minimum 3,0 ghz. " pamięć ram o pojemności minimum 16 gb. " dysk twardy o pojemności minimum 1 tb. " dvd rw. " cd rw " system operacyjny umożliwiający sterowanie oprogramowaniem analizatora. 13. oprogramowanie specjalistyczne 1.oprogramowanie do sterowania analizatorem i kolekcji danych. podać nazwę oprogramowania. 2.oprogramowanie do analizy sekwencji dna i analizy fragmentów dna automatyczne nazywanie alleli; badania aflp, snp, mikrosatelit, loh, hma, sscp, rer; porównania sekwencji dna do sekwencji wzorcowych; analiza snp; wykrywanie mutacji; oznaczanie heterozygotyczności; wyszukiwanie określonej sekwencji. podać nazwę oprogramowania. 3.oprogramowanie do archiwizacji wyników badań. podać nazwę oprogramowania. 14. monitor z ekranem o przekątnej minimum 17". 15. możliwość integracji oprogramowania analizatora z systemami typu lims (laboratory information management system). 16. komunikacja użytkownika z systemem w języku polskim lub angielskim. 17. zasilanie z sieci elektroenergetycznej 230 v ac 50 hz 18. . instrukcja obsługi w języku polskim lub angielskim w formie wydrukowanej i w wersji elektronicznej na nośniku elektronicznym wraz z dostawą przedmiotu zamówienia 19. urządzenie posiada certyfikat ce 20. zagwarantowanie dostępności serwisu, oprogramowania i części zamiennych przez co najmniej 7 lat od daty dostawy. zgodnie z opisem załącznika nr 1a. ii.2.5)kryteria udzielenia zamówienia kryteria określone poniżej kryterium jakości nazwa jakość / waga 30 cena waga 70 ii.2.6)szacunkowa wartość ii.2.7)okres obowiązywania zamówienia, umowy ramowej lub dynamicznego systemu zakupów okres w dniach 14 niniejsze zamówienie podlega wznowieniu nie ii.2.10)informacje o ofertach wariantowych dopuszcza się składanie ofert wariantowych nie ii.2.11)informacje o opcjach opcje nie ii.2.12)informacje na temat katalogów elektronicznych ii.2.13)informacje o funduszach unii europejskiej zamówienie dotyczy projektu/programu finansowanego ze środków unii europejskiej nie ii.2.14)informacje dodatkowe wadium 4 652 pln. wadium wnosi się w terminie i formie opisanej w specyfikacji. termin realizacji zamówienia dostawa nie później niż 14 dni od daty udzielenia zamówienia; instalacja, uruchomienie, szkolenie nie później niż do 28.2.2018 r. (w uzgodnieniu z zamawiającym). ii.2)opis ii.2.1)nazwa termocyklery do real time pcr część nr 3 ii.2.2)dodatkowy kod lub kody cpv 38000000 ii.2.3)miejsce świadczenia usług kod nuts pl213 główne miejsce lub lokalizacja realizacji zakład patologii nowotworów w siedzibie zamawiającego. ii.2.4)opis zamówienia 1.termocykler do real time pcr – 1 szt. 1.urządzenie umożliwiające przeprowadzanie ilościowej reakcji pcr w czasie rzeczywistym z użyciem barwników fluorescencyjnych2.jednoczesna amplifikacja i detekcja do 96 prób na płytkach 96 dołkowych lub paskach / stripach (po 8 probówek)3.zakres objętości mieszaniny reakcyjnej, w której można przeprowadzić reakcję pcr 10 – 50µl.4.powierzchnia bloku wykonana ze srebra5.blok z opcją gradientu zakres nastawialnej temperatury dla reakcji z wykorzystaniem opcji gradientu maksymalnie 20°c (w całkowitym zakresie temperatur 37 – 98°c) możliwość uzyskania w trakcie reakcji 12 różnych temperatur w obrębie płytki 96 dołkowej6.jednoczesne wzbudzenie fluorescencji wszystkich prób pojedyncza dioda led zainstalowana na stałe w aparacie (brak elementów ruchomych związanych z elementem wzbudzenia aparatu, średni okres żywotności diody ok. 10 000 godzin)7.system detekcyjny kamera ccd8.przekazywanie sygnału fluorescencyjnego z prób do systemu detekcyjnego za pośrednictwem światłowodów.9.aparat wyposażony w cztery kanały detekcji o następującym układzie filtrów wzbudzających / detekcyjnych 1. 470 / 514nm 2. 533 / 572nm 3. 577 / 620nm 4. 645 / 697,5nm10.analiza krzywej topnienia – ciągły, nieprzerwany i jednoczesny pomiar fluorescencji wszystkich prób w ustalonym zakresie temperatur.11.urządzenie nie wymaga przeprowadzania żadnych okresowych kalibracji systemu optycznego związanych z wykorzystaniem różnych barwników fluorescencyjnych lub stosowanych rodzajów analiz w celu zapewnienia optymalnego działania.12.urządzenie nie wymaga normalizacji z barwnikiem referencyjnym typu rox13.system umożliwiający analizę kwasów nukleinowych przy pomocy różnych barwników i sond molekularnych barwników interkalujących sybr greek, lc green, resolight dye (lub podobny) oraz sond hydrolizujących typu taqman14.oprogramowanie urządzenia wyposażone w dedykowane moduły do analizy ilościowej – analiza bezwzględna umożliwiająca pomiar ilości kopii dna w badanej próbie w oparciu o krzywą standardową (oprogramowanie podaje wartości wydajności reakcji, nachylenia krzywej, błędu standardowego oraz współczynnik r2) ilościowej – analiza względna umożliwiająca pomiar poziomu ekspresji genu badanego w stosunku do genu referencyjnego w oparciu o a) krzywą standardową (oprogramowanie podaje wartości wydajności reakcji, nachylenia krzywej, błędu standardowego oraz współczynnik r2) b) ręcznie wprowadzoną wartość wydajności, gdzie e=2 oznacza wydajność reakcji 100 %. c) możliwość zdefiniowania próbki jako „run calibrator” i „study calibrator” celem wyznaczenia stosunku znormalizowanego i wyskalowanego. genotypowania typu „end point” przy pomocy sond hydrolizujących do wykrywania mutacji (analiza dyskryminacji alleli) krzywej topnienia high resolution melting (hrm) / gene scanning (analiza mutacji/snp) z możliwością automatycznego grupowania prób o podobnym profilu do analizy jakościowej (wykrywanie obecności badanego dna bez określania parametrów ilościowych; możliwość dodania kontroli wewnętrznej reakcji – kontrola amplifikacji).15. opcje przeprowadzenia analizy z jednym barwnikiem (ustawienie mono color) lub dwoma / większą liczbą barwników (ustawienie „dual / multi color”) oprogramowanie z automatyczną możliwością oznacza próbki jako „positive, negative, invalid” lub „inconsistent” 2. termocykler do real time pcr – 1 szt. 1.urządzenie umożliwiające przeprowadzanie ilościowej reakcji pcr w czasie rzeczywistym z użyciem barwników fluorescencyjnych2.jednoczesna amplifikacja do 96 prób 3.zakres objętości mieszany reakcyjnej 10 100µl4. urządzenie nie wymaga przeprowadzania żadnych okresowych kalibracji systemu optycznego związanych z wykorzystaniem różnych barwników fluorescencyjnych5.srebrna powłoka bloku; opis parametrów pkt 6 16 w załączniku 1a. — wszystkie pozycje zgodnie z opisem załącznika nr 1a. ii.2.5)kryteria udzielenia zamówienia kryteria określone poniżej kryterium jakości nazwa jakość / waga 30 cena waga 70 ii.2.6)szacunkowa wartość ii.2.7)okres obowiązywania zamówienia, umowy ramowej lub dynamicznego systemu zakupów okres w dniach 14 niniejsze zamówienie podlega wznowieniu nie ii.2.10)informacje o ofertach wariantowych dopuszcza się składanie ofert wariantowych nie ii.2.11)informacje o opcjach opcje nie ii.2.12)informacje na temat katalogów elektronicznych ii.2.13)informacje o funduszach unii europejskiej zamówienie dotyczy projektu/programu finansowanego ze środków unii europejskiej nie ii.2.14)informacje dodatkowe wadium 2 320 pln. wadium wnosi się w terminie i formie opisanej w specyfikacji. termin realizacji zamówienia dostawa nie później niż 14 dni od daty udzielenia zamówienia; instalacja, uruchomienie, szkolenie nie później niż do 28.2.2018 r. (w uzgodnieniu z zamawiającym). ii.2)opis ii.2.1)nazwa mikroskop fluorescencyjny z systemem do analizy obrazu część nr 4 ii.2.2)dodatkowy kod lub kody cpv 38515200 ii.2.3)miejsce świadczenia usług kod nuts pl213 główne miejsce lub lokalizacja realizacji zakład patologii nowotworów w siedzibie zamawiającego. ii.2.4)opis zamówienia 1 mikroskop fluorescencyjny z systemem do analizy obrazu 1szt. 1. ergonomiczny statyw z nisko położonymi pokrętłami regulacji intensywności światła, przesuwu preparatów 2. współosiowa śruba mikro/makro do ustawiania ostrości 3. wbudowany pierścień blokady położenia stolika (wysokości) 4. minimalna działka odczytu na śrubie mikrometrycznej 1 mikrometr 5. oświetlenie jasnego pola wbudowane w bazę mikroskopu źródło światła typu led o mocy min 14w 6. oświetlenie wg systemu koehlera 7. wbudowany w bazę mikroskopu centralnie z przodu na dole regulator intensywności światła 8. przesłona (shutter) światła przechodzącego, montowana na oświetlaczu w celu eliminacji autofluorescencji od led owego źródła światła podczas obserwacji fluorescencyjnych; obserwacja w jasnym polu bez konieczności demontażu układu, a jedynie przez otwarcie przesłony. 9. system zarządzania oświetleniem z zakodowaniem intensywności oświetlenia dla każdego z obiektywów (zmiana intensywności oświetlenia przy zmianie obiektywu bez użycia komputera) zintegrowany bezpośrednio z bazą mikroskopu 10. optyka w systemie korekcji do nieskończoności 11. nasadka okularowa — trójokularowa, do okularów o polu widzenia minimum 26 mm, — regulowany kąt nachylenia w zakresie min. 5 35 stopni, — wbudowany 3 pozycyjny podzielnik światła między okularami/kamerą w proporcjach 100/0, 50/50, 0/100, — regulowany rozstaw źrenic w zakresie min. 50 75 mm 12. okulary powiększenie 10x, numer pola min. 26 13. każdy okular z wbudowanym pierścieniem korekcji dioptryjnej w zakresie min. 8/+2 dioptrii 14. obiektywy o długości optycznej nie dłuższej niż 45mm, o powiększeniu/ aperturze numerycznej (na)/ minimalnej odległości roboczej (wd) — plan apochromat 2x/ 0,08/ 6,2 mm — plan apochromat 4x/ na 0,16/ wd 13,0 mm — plan apochromat 10x/ na 0,40/ wd 3,1 mm — plan apochromat 20x/ na 0,75/ wd 0,6 mm — plan apochromat 40x/ na 0,95/ wd 0,18mm – suchy, korekcja grubości szkiełka nakrywkowego od 0.11 do 0.23 mm — plan apochromat 100x/ na 1,40/ wd 0,13 mm 15. kondensor o aperturze numerycznej min. na= 0,9, z uchylną soczewką czołową, przystosowany do pracy z obiektywami o powiększeniu od 1,25x do 100x (obserwacja na soczewce uchylonej dla obiektywów 1,25x, 2x, 4x), z regulowaną przesłoną aperturową 16. źródło światła fluorescencyjnego palnik rtęciowy o mocy min. 130w o emisji w zakresie 360 770nm. 7 pozycyjna kontrola intensywności światła (100 %, 50 %, 25 %, 12 %, 6 %, 3 %, 0 %). światłowód o długości min 1,5 metra. adapter do światłowodu. 17. kostki do fluorescencji 4 szt., każda z filtrem wzbudzającym, emisyjnym i lustrem dichroicznym, dostosowane do oświetlacza światła odbitego do fluorescencji — kostka 1 filtr pojedynczy orange, — kostka 2 filtr podwójny green/orange, — kostka 3 filtr potrójny aqua/green/orange, — kostka 4 filtr potrójny dapi/green/orange. 18. oświetlacz światła odbitego do fluorescencji, pozwalający na pracę metodami jasnego pola, kontrastu nomarskiego (dic), polaryzacji, wyposażony w min. 8 pozycyjny zmieniacz kostek z filtrami do fluorescencji posiadający funkcję odcięcia światła i łatwej wymiany kostek z filtrami bez użycia narzędzi, wyposażony w centrowalne przesłony polową i aperturową. 19. wymienny, kodowany uchwyt rewolwerowy na min. 7 obiektywów, współpracujący z systemem zarządzania oświetleniem 20. stolik mechaniczny z mechanizmem rolkowym przesuwu bez szyny zębatkowej, o trwałej powłoce ceramicznej z uchwytem na jeden preparat. możliwość obrotu w płaszczyźnie poziomej w zakresie min 250 stopni. prawostronne pokrętło przesuwu preparatów dla osi x, y z regulacją siły nacisku dla obu osi, przesuw w osi x (na długość preparatu) min. 75 mm a w osi y (na szerokość preparatu) min. 50 mm opis parametrów poz. 21.kamera, 22. adapter do kamery, 23 oprogramowanie, 24 zestaw komputerowy – w załączniku nr 1a do specyfikacji. — wszystkie pozycje zgodnie z opisem załącznika nr 1a. ii.2.5)kryteria udzielenia zamówienia kryteria określone poniżej kryterium jakości nazwa jakość / waga 30 cena waga 70 ii.2.6)szacunkowa wartość ii.2.7)okres obowiązywania zamówienia, umowy ramowej lub dynamicznego systemu zakupów okres w dniach 14 niniejsze zamówienie podlega wznowieniu nie ii.2.10)informacje o ofertach wariantowych dopuszcza się składanie ofert wariantowych nie ii.2.11)informacje o opcjach opcje nie ii.2.12)informacje na temat katalogów elektronicznych ii.2.13)informacje o funduszach unii europejskiej zamówienie dotyczy projektu/programu finansowanego ze środków unii europejskiej nie ii.2.14)informacje dodatkowe wadium 2 284 pln. wadium wnosi się w terminie i formie określonej w specyfikacji. termin realizacji zamówienia dostawa nie później niż 14 dni od daty udzielenia zamówienia; instalacja, uruchomienie, szkolenie nie później niż do 28.2.2018 r. (w uzgodnieniu z zamawiającym). sekcja iii informacje o charakterze prawnym, ekonomicznym, finansowym i technicznym iii.1)warunki udziału iii.1.1)zdolność do prowadzenia działalności zawodowej, w tym wymogi związane z wpisem do rejestru zawodowego lub handlowego wykaz i k