Sekwencjonowanie genomowe

Opis przedmiotu przetargu: Przedmiotem usługi jest sekwencjonowanie genomowe wraz z przygotowaniem bibliotek dla minimum 65 prób wysyłanych sukcesywnie w czasie trwania umowy, tj. od dnia jej zawarcia do 31.12.2017 r. Maksymalna (opcja) ilość prób w czasie trwania umowy będzie wynosiła 70 próbek Minimalne wymagane parametry usługi: - przygotowanie bibliotek o sparowanych końcach (długość wstawki <600 zasad) - sekwencjonowanie genomowe z minimalnym pokryciem 70x - podstawowa analiza bioinformatyczna (przycinanie odczytów, przygotowanie plików wynikowych w formacie fasta oraz danych surowych) Do Wykonawcy w celu wykonania usługi przesyłane będzie materiał genetyczny w postaci DNA i RNA wirusów zwierzęcych. Maksymalne parametry dostarczanego materiału jakie Zamawiający jest w stanie spełnić: 1. wyizolowane DNA/RNA zawieszone w buforze elucyjnym (objętość 50µl) 2. Stężenie próbki: do 10 ng/µl 3. Czystość próbki: OD260/280 = 1,6 - 2,0 Niezwłocznie po otrzymaniu materiału Wykonawca ma obowiązek sprawdzenia jego przydatności do analizy. Jeśli na tym etapie Wykonawca stwierdzi niemożliwość wykonania analizy zobowiązany jest do niezwłocznego powiadomienia osoby zlecającej usługę. Wymagane przeprowadzenie sekwencjonowania na urządzeniu Illumina. Wszystkie analizy powinny być wykonane na tym samym urządzeniu przez cały okres trwania umowy. Przewidywana ilość próbek przesyłanych jednorazowo do wykonawcy - ok.10. Dostarczenie wyników na nośniku w terminie 3 tygodni od dnia dostarczenia próbek