ZP/6/2015 - Dostawa odczynników do badań genetycznych z użyciem mikromacierzy CGH dla Zakładu Genetyki Instytutu CZMP

Opis przedmiotu przetargu: Zestaw do analizy niezrównoważeń genomowych techniką porównawczej hybrydyzacji genomowej do mikromacierzy (array CGH).
Zestaw składa się z :
1. 21 szkiełek mikromacierzowych. Na każdym szkiełku musi się znajdować 8 mikromacierzy oligonukleotydowych całogenomowych ISCA, 8x60k, o średniej rozdzielczości 60 kb. Konstrukcja macierzy musi zapewniać najkorzystniejszy z klinicznego i diagnostycznego punktu widzenia rozkład sond, pod kątem analizowanych w Zakładzie grup chorych (musi pokrywać również najnowsze geny, które zostały uznane za istotne klinicznie w ramach realizacji projektu Deciphering Developmental Delay. Najważniejsze z nich muszą być pokryte na poziomie pojedynczego eksonu, pozwalając na wykrywanie niezrównoważeń na tym poziomie). W regionach tzw. backbone gęstość sond musi być zróżnicowana, z największym pokryciem zarezerwowanym dla regionów o wysokim prawdopodobieństwie istotności klinicznej. Mikromacierz musi być kompatybilna z oprogramowaniem CytoSure Interpret software firmy OGT. Analiza zamówionych macierzy, ze względu na miejsce jej wykonywania (Zakład Genetyki Medycznej Instytutu Matki i Dziecka w Warszawie) musi być prowadzona wyłącznie za pomocą w/w oprogramowania. Wiąże się to również z możliwością korzystania z bazy danych pacjentów diagnozowanych w tym współpracującym ośrodku, co jest elementem niezbędnym w procesie prawidłowej analizy i interpretacji laboratoryjnej oraz klinicznej uzyskanych wyników badań. Odczynniki do mikromacierzy powinny pozwalać na uzyskanie bardzo dobrych parametrów jakościowych m. in. DLRS i signal to noise ratio - 21 sztuk.
2. Kompletny zestaw do znakowania i oczyszczania DNA, zoptymalizowany do rodzaju zamawianych macierzy, umożliwiający wysokiej jakości wyznakowanie próbek , zawierający m.in. znaczniki fluorescencyjne Cy3 i Cy5, mieszaninę nukleotydów, startery, enzym, kolumny do oczyszczania DNA, probówki (96 reakcji: 48 próbek badanych+48 próbek referencyjnych) - 7 zestawów
3. Szkiełka uszczelniające (backing slides) odpowiednie do zamawianych macierzy (8x60k) -21 sztuk
4. Kompletny zestaw do hybrydyzacji (zestaw odczynników umożliwiający przeprowadzenie hybrydyzacji do macierzy zawierający bufor do hybrydyzacji oraz Blocking Agent)- na 25 szkiełek - 1 op.
5. Zestaw buforów płuczących (Wash Buffer 1 i Wash Buffer 2 umożliwiający właściwe odpłukanie macierzy) - 2 op.
6. Human Cot-1-DNA (500 µl) - 1 op.