Dostawa 120 mikromacierzy na 30 płytkach do badania ekspresji genów dorsza i specjalistycznych materiałów diagnostycznych

Opis przedmiotu przetargu: 1. Przedmiotem zamówienia jest dostawa 120 mikromacierzy na 30 płytkach do badania ekspresji genów dorsza i specjalistycznych materiałów diagnostycznych dla Instytutu Oceanologii Polskiej Akademii Nauk w Sopocie, ul. Powstańców Warszawy 55, 81-712 Sopot. 2. Kod CPV: 33696500-0 Odczynniki laboratoryjne 3. Szczegółowy opis przedmiotu zamówienia: 1) Mikromacierze: - Macierze oligonukleotydowe składające się z sond sześćdziesięcio-merowych, syntetyzowanych in situ na płytkach szklanych o rozmiarze 1x3cala. - Na każdej płytce powinny znajdować się 4 macierze po 44 tysięcy sond każda. - Macierze mają służyć do badania ekspresji genów dorsza. - Macierz immunochip powinna być wykonana według projektu ACIQ-2 dr Aleksieja Krasnowa. 2) Zestawy odczynników: - Zestawy do znakowania i amplifikacji materiału dedykowane dla sześćdziesięcio-merowych macierzy oligonukleotydowych - 5 sztuk. - Zestaw na co najmniej 24 reakcje w każdym z kolorów (Cy3) i (Cy5). - Zestaw do płukania mikromacierzy oligonukleotydowych zawierający bufory do płukania slajdów. - Zestaw do hybrydyzacji mikromacierzy oligonukleotydowych dedykowany do pracy z mikromacierzami sześćdziesięcio-merowymi. - Zestaw co najmniej dwudziestu slajdów uszczelkowych niezbędnych do hybrydyzacji slajdu zawierającego cztery mikromacierze. 4. Ze względu na kontynuację prac naukowo-badawczych płytki i zestawy odczynników muszą być kompatybilne z systemem Agilent. 5. W ramach realizacji przedmiotu zamówienia Wykonawca wykona ocenę ilości i jakości dostarczonego RNA, amplifikacje i znakowanie 120 próbek RNA oraz przeprowadzi hybrydyzacje mikromacierzy, skanowanie i obrazowanie mikromacierzy z użyciem specjalistycznego oprogramowania przedstawiającego uzyskane wyniki w formie liczbowej. 6. Wykonawca dostarczy pełną dokumentację dotyczącą prowadzonych badań w formie wydruku lub wersji elektronicznej, z tym że Zamawiający wymaga, aby Wykonawca dostarczył : - wyniki RIN w formie plików pdf dla każdego zestawu badanych prób RNA, - raporty kontroli jakości hybrydyzacji dla każdej mikromacierzy w formie plików pdf, - wyniki hybrydyzacji w formie plików txt udostępnionych przez dropbox. 7. Wykonawca zobowiązany jest dostarczyć Zamawiającemu cała dokumentację przeprowadzonych analiz z surowymi danymi: 1) analiza jakości RNA - 120 próbki 2) amplifikacja i znakowanie 120 próbek 3) hybrydyzacja i płukanie płytek 4) skanowanie płytek 5) wyniki odczytów 8. Mikromacierze i odczynniki chemiczne powinny być objęte minimum 3 miesięczną gwarancją. 9. Oferowany przedmiot zamówienia musi być wolny od wszelkich wad i uszkodzeń, bez wcześniejszej eksploatacji i nie może być przedmiotem praw osób trzecich. 10. Zamawiający wymaga, aby Wykonawca dostarczył przedmiot zamówienia do siedziby Zamawiającego na swój koszt w terminie i na miejsce ustalone z Zamawiającym